Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX13Q9Y5W8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX13Q9Y5W8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX13Q9Y5W8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX13Q9Y5W8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX13Q9Y5W8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX13Q9Y5W8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX13Q9Y5W8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX13Q9Y5W8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
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