Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CDC42BPBQ9Y5S2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CDC42BPBQ9Y5S2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CDC42BPBQ9Y5S2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CDC42BPBQ9Y5S2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CDC42BPBQ9Y5S2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CDC42BPBQ9Y5S2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CDC42BPBQ9Y5S2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CDC42BPBQ9Y5S2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDC42BPBQ9Y5S2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CDC42BPBQ9Y5S2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CDC42BPBQ9Y5S2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CDC42BPBQ9Y5S2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CDC42BPBQ9Y5S2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CDC42BPBQ9Y5S2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CDC42BPBQ9Y5S2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CDC42BPBQ9Y5S2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CDC42BPBQ9Y5S2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CDC42BPBQ9Y5S2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CDC42BPBQ9Y5S2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CDC42BPBQ9Y5S2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CDC42BPBQ9Y5S2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CDC42BPBQ9Y5S2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CDC42BPBQ9Y5S2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms