Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXND1Q9Y4D7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXND1Q9Y4D7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXND1Q9Y4D7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLXND1Q9Y4D7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLXND1Q9Y4D7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLXND1Q9Y4D7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXND1Q9Y4D7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PLXND1Q9Y4D7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms