Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F4

STRAP, Serine-threonine kinase receptor-associated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRAPQ9Y3F4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRAPQ9Y3F4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
STRAPQ9Y3F4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRAPQ9Y3F4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRAPQ9Y3F4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STRAPQ9Y3F4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRAPQ9Y3F4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRAPQ9Y3F4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms