Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SPG7Q9UQ90 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SPG7Q9UQ90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SPG7Q9UQ90 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SPG7Q9UQ90 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SPG7Q9UQ90 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SPG7Q9UQ90 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SPG7Q9UQ90 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPG7Q9UQ90 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPG7Q9UQ90 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SPG7Q9UQ90 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPG7Q9UQ90 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPG7Q9UQ90 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SPG7Q9UQ90 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SPG7Q9UQ90 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPG7Q9UQ90 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SPG7Q9UQ90 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SPG7Q9UQ90 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPG7Q9UQ90 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
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