Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EPDR1Q9UM22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EPDR1Q9UM22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EPDR1Q9UM22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EPDR1Q9UM22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPDR1Q9UM22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPDR1Q9UM22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EPDR1Q9UM22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms