Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MBD1Q9UIS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MBD1Q9UIS9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MBD1Q9UIS9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD1Q9UIS9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD1Q9UIS9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD1Q9UIS9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD1Q9UIS9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD1Q9UIS9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MBD1Q9UIS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms