Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAI1Q9UI46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNAI1Q9UI46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAI1Q9UI46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DNAI1Q9UI46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNAI1Q9UI46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DNAI1Q9UI46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNAI1Q9UI46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DNAI1Q9UI46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNAI1Q9UI46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms