Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED13Q9UHV7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED13Q9UHV7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED13Q9UHV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MED13Q9UHV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED13Q9UHV7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED13Q9UHV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED13Q9UHV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED13Q9UHV7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED13Q9UHV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED13Q9UHV7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED13Q9UHV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms