Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBG3

CRNN, Cornulin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNNQ9UBG3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNNQ9UBG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNNQ9UBG3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRNNQ9UBG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRNNQ9UBG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRNNQ9UBG3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRNNQ9UBG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNNQ9UBG3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRNNQ9UBG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNNQ9UBG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNNQ9UBG3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNNQ9UBG3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRNNQ9UBG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNNQ9UBG3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNNQ9UBG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNNQ9UBG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms