Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN1

IL1RAPL1, Interleukin-1 receptor accessory protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPL1Q9NZN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1RAPL1Q9NZN1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IL1RAPL1Q9NZN1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IL1RAPL1Q9NZN1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IL1RAPL1Q9NZN1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IL1RAPL1Q9NZN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IL1RAPL1Q9NZN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL1RAPL1Q9NZN1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IL1RAPL1Q9NZN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IL1RAPL1Q9NZN1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IL1RAPL1Q9NZN1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IL1RAPL1Q9NZN1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IL1RAPL1Q9NZN1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IL1RAPL1Q9NZN1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IL1RAPL1Q9NZN1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IL1RAPL1Q9NZN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL1RAPL1Q9NZN1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IL1RAPL1Q9NZN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms