Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PODXL2Q9NZ53 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PODXL2Q9NZ53 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PODXL2Q9NZ53 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PODXL2Q9NZ53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PODXL2Q9NZ53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PODXL2Q9NZ53 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PODXL2Q9NZ53 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PODXL2Q9NZ53 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PODXL2Q9NZ53 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PODXL2Q9NZ53 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PODXL2Q9NZ53 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PODXL2Q9NZ53 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PODXL2Q9NZ53 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PODXL2Q9NZ53 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PODXL2Q9NZ53 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PODXL2Q9NZ53 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PODXL2Q9NZ53 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PODXL2Q9NZ53 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms