Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOR4AQ9NXH8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOR4AQ9NXH8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TOR4AQ9NXH8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOR4AQ9NXH8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOR4AQ9NXH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOR4AQ9NXH8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOR4AQ9NXH8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOR4AQ9NXH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms