Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TOR4AQ9NXH8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOR4AQ9NXH8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOR4AQ9NXH8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOR4AQ9NXH8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOR4AQ9NXH8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOR4AQ9NXH8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOR4AQ9NXH8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOR4AQ9NXH8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TOR4AQ9NXH8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOR4AQ9NXH8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOR4AQ9NXH8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOR4AQ9NXH8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOR4AQ9NXH8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOR4AQ9NXH8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TOR4AQ9NXH8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOR4AQ9NXH8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOR4AQ9NXH8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOR4AQ9NXH8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOR4AQ9NXH8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOR4AQ9NXH8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TOR4AQ9NXH8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TOR4AQ9NXH8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TOR4AQ9NXH8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TOR4AQ9NXH8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TOR4AQ9NXH8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TOR4AQ9NXH8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TOR4AQ9NXH8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TOR4AQ9NXH8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TOR4AQ9NXH8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOR4AQ9NXH8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TOR4AQ9NXH8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TOR4AQ9NXH8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOR4AQ9NXH8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOR4AQ9NXH8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOR4AQ9NXH8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TOR4AQ9NXH8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TOR4AQ9NXH8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOR4AQ9NXH8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOR4AQ9NXH8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOR4AQ9NXH8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TOR4AQ9NXH8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TOR4AQ9NXH8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOR4AQ9NXH8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TOR4AQ9NXH8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOR4AQ9NXH8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TOR4AQ9NXH8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOR4AQ9NXH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOR4AQ9NXH8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOR4AQ9NXH8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOR4AQ9NXH8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOR4AQ9NXH8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOR4AQ9NXH8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOR4AQ9NXH8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOR4AQ9NXH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOR4AQ9NXH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOR4AQ9NXH8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOR4AQ9NXH8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOR4AQ9NXH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOR4AQ9NXH8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOR4AQ9NXH8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOR4AQ9NXH8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TOR4AQ9NXH8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TOR4AQ9NXH8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TOR4AQ9NXH8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOR4AQ9NXH8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOR4AQ9NXH8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOR4AQ9NXH8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOR4AQ9NXH8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOR4AQ9NXH8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOR4AQ9NXH8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOR4AQ9NXH8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOR4AQ9NXH8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TOR4AQ9NXH8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TOR4AQ9NXH8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOR4AQ9NXH8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOR4AQ9NXH8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOR4AQ9NXH8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOR4AQ9NXH8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOR4AQ9NXH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOR4AQ9NXH8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOR4AQ9NXH8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOR4AQ9NXH8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOR4AQ9NXH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOR4AQ9NXH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOR4AQ9NXH8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOR4AQ9NXH8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOR4AQ9NXH8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms