Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCM2LQ9NUG4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCM2LQ9NUG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCM2LQ9NUG4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCM2LQ9NUG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCM2LQ9NUG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCM2LQ9NUG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCM2LQ9NUG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCM2LQ9NUG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms