Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C19orf12Q9NSK7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C19orf12Q9NSK7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C19orf12Q9NSK7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C19orf12Q9NSK7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C19orf12Q9NSK7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf12Q9NSK7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf12Q9NSK7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C19orf12Q9NSK7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms