Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
THSD1Q9NS62 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THSD1Q9NS62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
THSD1Q9NS62 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
THSD1Q9NS62 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THSD1Q9NS62 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THSD1Q9NS62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THSD1Q9NS62 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD1Q9NS62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms