Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASSF1Q9NS23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASSF1Q9NS23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF1Q9NS23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF1Q9NS23 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF1Q9NS23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF1Q9NS23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms