Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPRD1BQ9NQG5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPRD1BQ9NQG5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1BQ9NQG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1BQ9NQG5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPRD1BQ9NQG5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms