Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC8

IFT46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT46Q9NQC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFT46Q9NQC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT46Q9NQC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT46Q9NQC8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT46Q9NQC8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT46Q9NQC8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT46Q9NQC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms