Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XAB2Q9HCS7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XAB2Q9HCS7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XAB2Q9HCS7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XAB2Q9HCS7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XAB2Q9HCS7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XAB2Q9HCS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XAB2Q9HCS7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XAB2Q9HCS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XAB2Q9HCS7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XAB2Q9HCS7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XAB2Q9HCS7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms