Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK4

ROBO2, Roundabout homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO2Q9HCK4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
ROBO2Q9HCK4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ROBO2Q9HCK4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ROBO2Q9HCK4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ROBO2Q9HCK4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
ROBO2Q9HCK4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ROBO2Q9HCK4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.78
ROBO2Q9HCK4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.78
ROBO2Q9HCK4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.78
ROBO2Q9HCK4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ROBO2Q9HCK4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ROBO2Q9HCK4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ROBO2Q9HCK4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ROBO2Q9HCK4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ROBO2Q9HCK4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ROBO2Q9HCK4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ROBO2Q9HCK4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ROBO2Q9HCK4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ROBO2Q9HCK4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ROBO2Q9HCK4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ROBO2Q9HCK4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ROBO2Q9HCK4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ROBO2Q9HCK4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ROBO2Q9HCK4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ROBO2Q9HCK4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms