Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC4CQ9HCJ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4CQ9HCJ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC4CQ9HCJ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC4CQ9HCJ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC4CQ9HCJ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC4CQ9HCJ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4CQ9HCJ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4CQ9HCJ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms