Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMURF2Q9HAU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMURF2Q9HAU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMURF2Q9HAU4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMURF2Q9HAU4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMURF2Q9HAU4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMURF2Q9HAU4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMURF2Q9HAU4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMURF2Q9HAU4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMURF2Q9HAU4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms