Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MFSD1Q9H3U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFSD1Q9H3U5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MFSD1Q9H3U5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFSD1Q9H3U5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MFSD1Q9H3U5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MFSD1Q9H3U5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MFSD1Q9H3U5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MFSD1Q9H3U5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MFSD1Q9H3U5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MFSD1Q9H3U5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms