Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RNF17Q9BXT8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RNF17Q9BXT8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RNF17Q9BXT8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RNF17Q9BXT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.78■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
RNF17Q9BXT8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
RNF17Q9BXT8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
RNF17Q9BXT8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
RNF17Q9BXT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RNF17Q9BXT8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RNF17Q9BXT8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RNF17Q9BXT8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RNF17Q9BXT8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
RNF17Q9BXT8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
RNF17Q9BXT8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
RNF17Q9BXT8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RNF17Q9BXT8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RNF17Q9BXT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RNF17Q9BXT8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RNF17Q9BXT8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms