Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDA1Q9BW61 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDA1Q9BW61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDA1Q9BW61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDA1Q9BW61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDA1Q9BW61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDA1Q9BW61 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDA1Q9BW61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDA1Q9BW61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms