Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPKQ9BS16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPKQ9BS16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPKQ9BS16 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPKQ9BS16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPKQ9BS16 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPKQ9BS16 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPKQ9BS16 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms