Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TREX2Q9BQ50 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREX2Q9BQ50 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREX2Q9BQ50 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREX2Q9BQ50 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREX2Q9BQ50 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREX2Q9BQ50 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TREX2Q9BQ50 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREX2Q9BQ50 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TREX2Q9BQ50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TREX2Q9BQ50 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TREX2Q9BQ50 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TREX2Q9BQ50 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms