Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIPEPQ99797 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MIPEPQ99797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MIPEPQ99797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MIPEPQ99797 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MIPEPQ99797 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MIPEPQ99797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MIPEPQ99797 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MIPEPQ99797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MIPEPQ99797 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms