Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
RSF1Q96T23 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
RSF1Q96T23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
RSF1Q96T23 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
RSF1Q96T23 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC49.5■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC49.45■■■■■ 5.51
RSF1Q96T23 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC49.43■■■■■ 5.5
RSF1Q96T23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC49.39■■■■■ 5.5
RSF1Q96T23 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.36■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.36■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
RSF1Q96T23 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC49.3■■■■■ 5.48
RSF1Q96T23 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
RSF1Q96T23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.48
RSF1Q96T23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
RSF1Q96T23 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
RSF1Q96T23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
RSF1Q96T23 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
RSF1Q96T23 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
RSF1Q96T23 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC49.18■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
RSF1Q96T23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC49.12■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC49.12■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC49.1■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC49.08■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
RSF1Q96T23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC49.06■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC49.06■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC49.02■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC49■■■■■ 5.44
RSF1Q96T23 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
RSF1Q96T23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
RSF1Q96T23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
RSF1Q96T23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
RSF1Q96T23 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
RSF1Q96T23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.91■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC48.9■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
RSF1Q96T23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC48.82■■■■■ 5.41
RSF1Q96T23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.79■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC48.78■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.4
RSF1Q96T23 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.73■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.72■■■■■ 5.39
RSF1Q96T23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms