Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX22Q96L94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX22Q96L94 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX22Q96L94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX22Q96L94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX22Q96L94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX22Q96L94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX22Q96L94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.3 ms