Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3YL1Q96HL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3YL1Q96HL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3YL1Q96HL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3YL1Q96HL8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3YL1Q96HL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3YL1Q96HL8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3YL1Q96HL8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3YL1Q96HL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms