Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZC2HC1AQ96GY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZC2HC1AQ96GY0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZC2HC1AQ96GY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZC2HC1AQ96GY0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC2HC1AQ96GY0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZC2HC1AQ96GY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms