Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFT1Q96AA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RFT1Q96AA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFT1Q96AA3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFT1Q96AA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFT1Q96AA3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFT1Q96AA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFT1Q96AA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFT1Q96AA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms