Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKD1Q969G9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD1Q969G9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKD1Q969G9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKD1Q969G9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD1Q969G9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NKD1Q969G9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NKD1Q969G9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKD1Q969G9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKD1Q969G9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms