Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXJ1Q92949 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXJ1Q92949 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXJ1Q92949 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXJ1Q92949 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXJ1Q92949 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXJ1Q92949 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXJ1Q92949 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXJ1Q92949 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXJ1Q92949 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXJ1Q92949 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXJ1Q92949 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms