Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA1Q92743 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA1Q92743 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA1Q92743 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA1Q92743 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA1Q92743 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HTRA1Q92743 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTRA1Q92743 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms