Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C9orf43Q8TAL5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf43Q8TAL5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf43Q8TAL5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C9orf43Q8TAL5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C9orf43Q8TAL5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf43Q8TAL5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf43Q8TAL5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf43Q8TAL5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms