Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHR9

PFN4, Profilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN4Q8NHR9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFN4Q8NHR9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PFN4Q8NHR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PFN4Q8NHR9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PFN4Q8NHR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PFN4Q8NHR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PFN4Q8NHR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFN4Q8NHR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFN4Q8NHR9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFN4Q8NHR9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFN4Q8NHR9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms