Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MINDY1Q8N5J2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MINDY1Q8N5J2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MINDY1Q8N5J2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MINDY1Q8N5J2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MINDY1Q8N5J2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MINDY1Q8N5J2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MINDY1Q8N5J2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MINDY1Q8N5J2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MINDY1Q8N5J2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms