Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4N3

KLHL36, Kelch-like protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL36Q8N4N3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL36Q8N4N3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL36Q8N4N3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL36Q8N4N3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL36Q8N4N3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL36Q8N4N3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL36Q8N4N3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms