Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZY2

ABCA7, ATP-binding cassette sub-family A member 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA7Q8IZY2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA7Q8IZY2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCA7Q8IZY2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCA7Q8IZY2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCA7Q8IZY2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCA7Q8IZY2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCA7Q8IZY2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCA7Q8IZY2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCA7Q8IZY2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCA7Q8IZY2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms