Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB3

SRRM1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM1Q8IYB3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRM1Q8IYB3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRM1Q8IYB3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRRM1Q8IYB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRRM1Q8IYB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRRM1Q8IYB3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRM1Q8IYB3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRM1Q8IYB3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRM1Q8IYB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRM1Q8IYB3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms