Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
N4BP2Q86UW6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
N4BP2Q86UW6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
N4BP2Q86UW6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
N4BP2Q86UW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
N4BP2Q86UW6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
N4BP2Q86UW6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
N4BP2Q86UW6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
N4BP2Q86UW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
N4BP2Q86UW6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
N4BP2Q86UW6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
N4BP2Q86UW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
N4BP2Q86UW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
N4BP2Q86UW6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
N4BP2Q86UW6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
N4BP2Q86UW6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
N4BP2Q86UW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
N4BP2Q86UW6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms