Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPNS3Q6ZMD2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPNS3Q6ZMD2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPNS3Q6ZMD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPNS3Q6ZMD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPNS3Q6ZMD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPNS3Q6ZMD2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms