Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC36A4Q6YBV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC36A4Q6YBV0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC36A4Q6YBV0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC36A4Q6YBV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC36A4Q6YBV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC36A4Q6YBV0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC36A4Q6YBV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC36A4Q6YBV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC36A4Q6YBV0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms