Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP4R4Q6NUP7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R4Q6NUP7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP4R4Q6NUP7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP4R4Q6NUP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP4R4Q6NUP7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R4Q6NUP7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP4R4Q6NUP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP4R4Q6NUP7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP4R4Q6NUP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP4R4Q6NUP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP4R4Q6NUP7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms