Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
B4GALNT3Q6L9W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
B4GALNT3Q6L9W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
B4GALNT3Q6L9W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
B4GALNT3Q6L9W6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
B4GALNT3Q6L9W6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
B4GALNT3Q6L9W6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
B4GALNT3Q6L9W6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
B4GALNT3Q6L9W6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
B4GALNT3Q6L9W6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
B4GALNT3Q6L9W6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
B4GALNT3Q6L9W6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
B4GALNT3Q6L9W6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
B4GALNT3Q6L9W6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
B4GALNT3Q6L9W6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
B4GALNT3Q6L9W6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
B4GALNT3Q6L9W6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
B4GALNT3Q6L9W6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
B4GALNT3Q6L9W6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms