Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ANKRD40Q6AI12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ANKRD40Q6AI12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ANKRD40Q6AI12 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ANKRD40Q6AI12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ANKRD40Q6AI12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ANKRD40Q6AI12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ANKRD40Q6AI12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ANKRD40Q6AI12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ANKRD40Q6AI12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ANKRD40Q6AI12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ANKRD40Q6AI12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ANKRD40Q6AI12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ANKRD40Q6AI12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ANKRD40Q6AI12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ANKRD40Q6AI12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ANKRD40Q6AI12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ANKRD40Q6AI12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ANKRD40Q6AI12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms